COMENTARIOS (TAREA RAQUEL Y LESLIE ONEAL)

Árbol filogenético universal
"Lo que ayer creía todo el mundo y lo que Ud. cree hoy, no lo creerán mañana más que los necios"
Sir Francis Crick
Versión simplificada y modificada del Árbol filogenético Universal establecido por Carl Woese y su discípulo Gary Olsen que muestra los tres Dominios. El termino "dominio" refiere a un nuevo taxón filogenético que incluye tres líneas primarias: Archaea, Bacteria y Eucaria. En línea descendente siguen seis Reinos: I-Moneras, II-Arqueobacterias (obviamente separadas de Moneras), III-Protistos, IV-Hongos, V-Plantas y VI-Animales.
En realidad al título cabría agregarle: "del mundo celular" ya que no incluye a virus, viriones....Se incluye en este esquema a LUCA.El "árbol" de la vida construido a partir de los estudios del ARNr (ácido ribonucleico ribosómico, al árbol se basa en el estudio de las diferencias en las secuencias de ARNr comunes a todos los "seres vivos"), muestra cercano a su "raíz" (allí donde se encuentra LUCA, último antepasado común universal de las células modernas, compartido por todos los "seres vivos") organismos "hipertermófilos" que viven a temperaturas cercanas a los 115 grados centígrados. Podría pensarse que la vida "transitó por la senda de los sistemas hidrotermales" o, por que no, se originó en ellos.
Pero bien podríamos colocar en la base un manojo de raíces o nube difusa para representar a la "Comunidad ancestral común de células primitivas" a partir de la cual divergieron ramas que dieron orígenes a los tres dominios actuales y además surcar la grafica con enlaces transversales entre ramas para indicar la existencia de una transferencia horizontal de genes. Ver Bibliografía. Ver árbol alternativo.
Monera el reino procariota
Las bacterias (del griego bakterion = bastón) son organismos unicelulares que se reproducen por fisión binaria. Su tamaño es del orden de los micrones e implica una relación superficie volumen muy alta: aproximadamente 100.000.Las Bacterias se encuentran prácticamente en todos lo ambientes de la Tierra, desde las profundas fosas oceánicas o el interior de rocas sólidas hasta las camisas refrigerantes de los reactores nucleares, ni que decir del resto de los hábitats. La mayoría de ellas son capaces de una existencia independiente pero existen especies como Chlamydia y Rickettsia que son organismos intracelulares obligados[W1] . Se encontraron estructuras semejantes a las bacterias en un meteorito marciano con una antigüedad de 3.000 millones de años (el llamado ALH84001, encontrado en la Antártida). De confirmarse la naturaleza de estas investigaciones, y si la descripción de lo encontrado correspondiera realmente a restos fósiles, sería de presumir la existencia simultánea de vida bacteriana en Marte y la Tierra (¿en ese entonces?). Hasta el momento, la naturaleza celular de estas estructura no ha sido establecida. Para una ampliación de este tema que se relaciona con el origen de la vida en la Tierra consultar este enlace.
El Reino taxonómico Monera comprende, entre otras, a las eubacterias (las bacterias "verdaderas" y las cianobacterias, o bacterias fotosintetizadoras).
Los organismos de este grupo no poseen organelas rodeadas por membranas (como las formas superiores de vida) y se conocen como procariotas.
Procesos bioquímicos que en eucariotas ocurren normalmente en los cloroplastos o mitocondrias, tienen lugar en la membrana citoplasmática.
El cromosoma bacteriano esta constituido por ADN circular que se ubica en la región denominada nucleoide
Distribuidos en el citoplasma bacteriano se encuentran pequeños lazos de ADN conocidos como plásmidos.
Los genes bacterianos se encuentran organizados en un sistema conocido como operón.
Su pequeño tamaño, velocidad de reproducción (Escherichia coli se reproduce por fisión binaria cada 15 o 20 minutos), y la "ocupación" de diversos hábitats y modos de existencia hacen de Moneras el Reino más abundante y diversificado sobre la Tierra[W2] .
Una manera de clasificar las bacterias es subdividirlas de acuerdo a la forma en que adquieren su energía en:
Quimiosintetizadoras
Son autótrofas, y obtienen energía de la oxidación de compuestos inorgánicos como el amonio, los nitritos (a nitratos) o los sulfuros (a sulfatos).
Fotosintetizadoras

Convierten la energía lumínica en energía almacenada en carbohidratos. El grupo mas importante es el de las cianobacterias. Probablemente las primitivas cianobacterias formaron el oxígeno que se liberó en la primitiva atmósfera terrestre. Poseen clorofila a y también el pigmento azul ficocianina y el rojo ficoeritrina.
Heterotrófas
Los miembros de este grupo obtienen su energía de materia orgánica elaborada por otros organismos. Podemos señalar dos grandes grupos: las saprofitas y las simbióticas.Las saprofitas se alimentan de materia muerta o en descomposición siendo por lo tanto importantes recicladores de nutrientes. muchas de las que entablan relaciones simbióticas lo hacen en forma mutualística y colaboran con su huésped, ejemplo de ellos son las bacterias que en la vaca y otros rumiantes convierten la celulosa en glucosa asimilable por el animal.Otras entablan una relación parasitaria y se constituyen en patógenas para su huésped produciendo enfermedades tales como la fiebre reumática, cólera, gonorrea, sífilis. La patogenicidad puede derivar de causas tales como destrucción celular, liberación de toxinas o la misma reacción del cuerpo a la bacteria infectante. Las infecciones bacterianas pueden ser controladas, entre otros, por tratamiento con antibióticos. Los antibióticos son productos que interfieren en algún punto del procesos de división de las bacterias, son producidos por microorganismos tales como los hongos, que compiten con las bacterias por los recursos disponibles. Sin embargo el extendido uso de los mismos impuso una presión evolutiva de una intensidad antes inexistente que llevo, por el proceso de selección natural, a la expansión de cepas resistentes a los antibióticos. Esto en muchos casos lleva a frecuentes cambios de tratamiento de las enfermedades y a la necesidad de nuevos desarrollo de antibióticos[W3] .
Las aqueobacterias
El grupo más antiguo, las arqueobacterias, constituyen un fascinante grupo de organismos y por sus especiales características se considera que conforman un Dominio separado: Archaea.Si bien lucen como bacterias poseen características bioquímicas y genéticas que las alejan de ellas. Por ejemplo:
no poseen paredes celulares con peptidoglicanos;
poseen secuencias únicas en su ARN
algunas de ellas poseen esteroles en su membrana celular (una característica de eucariotas),
poseen lípidos de membrana diferentes tanto de las bacterias como de los eucariotas (incluyendo enlaces éter en lugar de enlaces ester[W4] ).
Células de Sulfolobus acidocaldarius adheridas a un cristal de sulfuro, observadas con microscopia de fluorescencia
Corte de Sulfolobus acidocaldarius observado con microscopio electrónico de transmisión(85.000 X)

Imágenes obtenidas de http://www.bact.wisc.edu/Bact303/MajorGroupsOfProkaryotes.
Hoy se encuentran restringidas (bueno lo de restringidas, si se lee mas adelante , ya no parece un termino aplicable) a hábitats marginales como fuentes termales, depósitos profundos de petróleo caliente, fumarolas marinas, lagos salinosos (incluso en el mar Muerto...). Por habitar ambientes "extremos",se las conocen también con el nombre de extremófilas.Existen tres tipos de arqueobacterias:
Metanogénicas: (generadoras de metano), crecen en condiciones anaeróbicas oxidando el hidrógeno. Para ello utilizan el CO2 como oxidante, en el proceso lo reducen a metano (CH4). Las metanogénicas usan ácidos orgánicos simples como el acetato para sintetizar sus componentes celulares. Estos ácidos orgánicos son producidos por otras bacterias anaeróbicas como producto final de la descomposición de la celulosa u otros polímeros. Por lo tanto las metanogénicas son abundantes donde existe materia orgánica y condiciones de anaerobiosis (por ej. rumen de las vacas)
Halófilas: desarrollan en ambientes salinos. Requieren una concentración de al menos 10% de cloruro de sodio para su crecimiento
Termófilas : desarrollan a temperaturas de 80oC y pH extremadamente bajos.
Se considera que las condiciones de crecimiento semejan a las existentes en los primeros tiempos de la historia de la Tierra por ello a estos organismos se los denominó arqueobacterias (del griego arkhaios = antiguo[W5] ).
Descubriendo nuevos microbios
En esencia el método consiste en la extracción de ADN de una muestra del medio ambien-e, separar sus filamentos y mezclarlos con un "cebador" (una secuencia corta de ADN que se combinará con una secuencia complementaria del ADN de la muestra). Luego utilizando la el ADN de la muestra será sintetizado (y amplificado...) comenzando en el punto donde se pegó el cebador y continuando a lo largo de la cadena de ADN.Si se utiliza como cebador regiones altamente conservadas de los genes que codifican el ARNr de la (subunidad pequeña de los ribosomas), los genes de los ribosomas de la muestra serán copiados y su secuencia comparada con la de los organismos conocidos.
Toda secuencia nueva de genes representa un nuevo organismo, y puede representarse en el árbol filogenético construido a partir de la secuencia de los genes de la subunidad pequeña de los ribosomas.De esta manera se descubrieron nuevos tipos de arqueobacterias en los ambientes marinos. Parecen ser bastante comunes y la abundancia de su ADN en las aguas superficiales costeras sugieren que pueden representar hasta el 34% de la biomasa correspondiente a los procariotas en ciertas épocas del año.
El registro fosil
La evidencia fósil soporta la idea que el origen de la vida en la Tierra comenzó en épocas tempranas: hace ya 3.500 millones de años, en notación científica un billón (o mil millones)= un Giga, Ga abrevia por Giga-años.Los fósiles más antiguos provienen de rocas marinas, como la piedra caliza y la piedra arenizca, formadas en el antiguo océano. J. William Schopf de la Universidad de California, Los Ángeles (UCLA) descubrió recientemente posibles procariotas fotosintetizadores en rocas de 3,5 Ga; y son de tal complejidad que el hecho sugiere que formas primitivas debieron existir antes. De rocas obtenidas de Groenlandia se obtuvieron posiblemente las más antiguas células 3,8 (?) Ga.La roca más antigua conocida en la Tierra tiene 3,96 Ga y proviene de la región canadiense del Ártico.

por lo tanto, a partir de estas evidencias podemos suponer que la vida en la Tierra comenzó rápidamente luego del enfriamiento de la corteza y la formación de la atmósfera y los océanos.
Recientes descubrimientos de la existencia de bacterias en las fosas marinas, en las cuales las placas tectónicas dejan lugar a fisuras. El calor y los materiales resultantes de esta circunstancia conforman un ambiente particular donde se desarrollan bacterias. Esto permite presuponer otro lugar donde la vida pudo haberse originado: en estas fosas marinas donde el calor y la roca derretida aflora a la superficie de la Tierra[W6] .
Estromatolitos
El curso de la evolución puede ser reconstruido estudiando el registro fósil. Los fósiles son los restos mineralizados de organismos de períodos geológicos previos, que proporcionan un registro de la historia geológica de la tierra.
Los fósiles microbianos se han encontrado en rocas compuestas por finas capas denominadas estromatolitos, formados por bacterias heterótrofas y fotótrofas que vivían en un tipo de colonias. Las cianobacterias se encuentran en la superficie externa y otras bacterias fotosintetizadoras (anaerobias) se encuentran inmediatamente por debajo de ellas. Por debajo de las capas fotótrofas se encuentran capas de bacterias heterótrofas. Las capas de los estromatolitos son alternativamente biogénicas y sedimentarias en su origen.
Los estromatolitos se siguen formando todavía en la actualidad y son relativamente comunes en lagunas y aguas termales. Los fósiles microbianos mas antiguos son de hace unos 3500 millones de años, casi tan antiguos como las rocas mas antiguas (3800 millones de años).
[W7] .


Composición Química
La célula bacteriana tiene un contenido en agua del 70 al 85%.El peso húmedo (masa húmeda) de los seres unicelulares se estima mediante centrifugación y separación de la masa celular de su medio de cultivo.El peso seco (masa seca) se estima luego de evaporar toda el agua, y estará comprendido por lo tanto entre el 15 al 30% del peso húmedo.Si las células contienen grandes cantidades de materiales de reserva (es decir, lípidos, polisacáridos, polifosfatos o azufre) el peso seco es proporcionalmente superior.Los datos de la composición elemental y la distribución de los compuestos orgánicos integrantes del peso seco se dan en las tablas siguientes[W8]
Composición elemental
Elemento
Porcentaje
Carbono
50 %
Oxígeno
20 %
Nitrógeno
14 %
Hidrógeno
8 %
Fósforo
3 %
Azufre
1 %
Potasio
1 %
Calcio
0,5 %
Magnesio
0,5 %
Hierro
0,2 %
Composición del peso seco
Polímero
Porcentaje
Proteínas
50 %
Pared celular
10-20 %
ARN
10-20 %
ADN
3-4 %
Lípidos
10 %
Forma y tamaño
Las bacterias típicamente tienen una de estas tres formas:
cilíndrica (bacilos):
esférica (cocos), el diámetro de los micrococos es de solo 0,5 µm
espiralada (espirilos)
Son unicelulares y a menudo se agrupan formando agregados o filamentos. Generalmente son muy pequeñas su tamaño es del orden del micrón.
Tabla I
Nombre de la bacteria
Diámetro
Longitud
Pseudomona aeruginosa
0,4-0,5 µm
2-3 µm
Chromatium okenii
5 µm
20 µm
Escherichia coli
1 µm
5 µm
Thiospirillum jenense
3,5 µm
50 µm
Epulopiscium fishelsoni
250 µm

Thiomargarita namibiensis
0,75 mm

Las de forma bacilar generalmente tienen 1 µm de diámetro y 5 µm de largo, las de 20 o más micras de largo se consideran "gigantes". Las bacterias gigantes son de crecimiento lento, la mayor de ellas es Thiomargarita namibiensis, bacteria esférica cuyo diámetro puede alcanzar 0,75 mm.
Al microscopio los miembros de los géneros Pseudomonas y Bacillus se observan como varillas (bacilos) rectos.
El género Vibrio aparece como un bacilo curvado o forma de coma
El género Corynebacterium tiene forma de maza y tendencia a cambiar de forma
El género Mycobacterium presenta ramificaciones incipientes.
El género Streptomyces puede formar un micelio
El método usual de división en procariotas es la fisión binaria. Tras el alargamiento de la célula construyen de afuera hacia dentro paredes transversales que van progresando, y las células hijas se separan. Sin embargo muchas de ellas en determinadas condiciones, permanecen unidas durante un cierto tiempo, dando origen a agrupaciones características. Según el plano y número de divisiones pueden encontrarse en bacterias esféricas:
diplococos
estreptococos
estafilococos
sarcinas[W9]
Diferencias con eucariotas
Si bien la célula eucariota se describe in extenso es conveniente dejar planteadas aquí sus principales diferencias con la procariota.
Estructura/Proceso
en Eucariotas
en Procariotas
Membrana nuclear
Presente
Ausente
ADN
Combinado con proteínas (histonas)
Desnudo y circular
Cromosomas
Múltiples
Único
División celular
Mitosis o Meiosis
Fisión binaria
Mitocondria
Presentes (con ribosomas 70S)
Ausente. Los procesos bioquímicos equivalentestienen lugar en la membrana citoplasmática.
Cloroplasto
Presentes en células vegetales (con ribosomas 70S)
Ribosomas
80S(a 60S y 40S sus subunidades)
70S(a 50S y 30S sus subunidades)
Pared celular
Presente en vegetales constituida por celulosa
Presente constituida por mureína
Nucléolos
Presentes
Ausentes
Retículo endoplásmico
Presente
Ausente
Órganos de locomoción
Cilios y flagelos que al corte transversal presentan una distribución característica de microtúbulos: 9+ 2
Flagelos sin estructura 9+2
Especie bacteriana
La definición moderna de especie puede ser aplicada a la mayoría de los eucariotas, incluyendo hongos, algas y protozoos, pero no es aplicable a los procariotas, ya que la reproducción y el intercambio genético no son esenciales en su ciclo de vida.
Dado que los microbiólogos necesitan identificar y clasificar las bacterias por diferentes razones prácticas, una especie puede definirse como una colección de cepas similares, que difieren lo suficiente de otros grupos de cepas para asegurar su reconocimiento como unidad taxonómica básica. Para ser exactos. una especie procariota podría definirse de manera precisa a partir de sus secuencia de ARNr. A pesar de no estar completamente aceptado, se ha propuesto que dos procariotas cuyo ARNr 16S tenga un 97% o mas de secuencias idénticas es muy probable que pertenezcan a la misma especie.
Lo usual es que se defina una especie a partir de la caracterización de varias cepas o clones. Siendo CLON una población de células genéticamente idénticas derivadas de una (1) sola célula[W10] .


[W1]En este apartado mi compañera y yo analizamos y aprendimos que las bacterias son organismos unicelulares, que su reproducción es por fisión binaria. La verdad nos pareció muy interesante ya que hay temas que no conocíamos muy bien y gracias a esto podemos aprenderlo.
Nos interesamos también en donde dice que las bacterias están prácticamente en todos los ambientes y creemos que eso es demasiado cierto , desde el lugar más visto hasta el más profundo.

[W2]Wow que interesante nos pareció este párrafo, nos menciona sobre el reino monera y lo que comprende, por ejemplo: las eubacterias que son las bacterias verdaderas y las cianobacterias que son las fotosintetizadoras Los organismos de este grupo no poseen organelas y se conocen como procariotas.


[W3]En este párrafo que catalizamos como importante nos dice una manera de clasificar las bacterias conforme a su energía, ejemplo: las quimiozintetizadoras : son autótrofas y obtienen energía del de la oxidacion de compuestos organicos. Fotosintetizadoras:convierten la energía lumínica en energía almacenada en carbohidratos . heterótrofas: obtienen energía de materia organica elaborada por otros organismos además hay 2 grandes grupos las saprofitas y simbióticas.

[W4]ARQUEOBACTERIAS: CONSTITUYEN UN FASINANTE GRUPO DE ORGANISMOS Y POR SUS ESPECIALES CARACTERISTICAS SE CONSIDERA QUE CONFORMAN UN DOMINIO SEPARADO ARCHEA : NO POSEE PAREDES CELULARES, POSEE SECUENCIAS EN SU ARN, ALGUNAS POSEEN ESTEROLES EN LA MEBRANA , POSEEN LIPIDOS DE MEMBRANA DIFERENTES WOW CUANTA INFORMACION GRACIAS PROFE¡¡¡¡¡¡

[W5]METANOGENICAS: jamás imaginamos que generara metano oh por dios, os menciona que crecen en condiciones anaeróbicas oxidando el hidrogeno y para elo utilizan CO2 como oxidante, HALOFITAS: se desarrollan en ambientes salinos requieren 10 % de cloruro de sodio para su crecimiento.
TERMOFILAS: se desarrollan a temp. De 80oC y Ph extremamente bajos

[W6]Los fosiles soportan la idea de que los fosiles los el origen de la vida y que comezo en épocas tempranas.como conclusión podemos de cir que: A partir de las evidencias podmos suponer que la vida en la tierra comenzó rápidamente luego del enfriamiento de la corteza y la formación de kla atmosfera y los océanos.

[W7]ESTROMATOLITOS: Los fósiles microbianos se han encontrado en rocas compuestas por finas capas denominadas estromatolitos, formados por bacterias heterótrofas y fotótrofas que vivían en un tipo de colonias. colonias

[W8]La verdad no le entendimos muy bien pero podemos redumir que La célula bacteriana tiene un contenido en agua del 70 al 85%. Y se puede clasificar en el peso húmedo y e peso seco. Tienen distinta composición elemntal por ejemplo el peso húmedo contien carbono, nitrógeno,oxigeno y el peso seco proteínas 50% adn 3-4 % y lípidos 10% claro esos son algunos.

[W9]FORMA Y TAMAÑO: Las bacterias típicamente tienen una de estas tres formas:
1. cilíndrica (bacilos):
2. esférica (cocos), el diámetro de los micrococos es de solo 0,5 µm
3. espiralada (espirilos)
El método usual de división en procariotas es la fisión binaria. Tras el alargamiento de la célula construyen de afuera hacia dentro paredes transversales que van progresando, y las células hijas se separan. Sin embargo muchas de ellas en determinadas condiciones, permanecen unidas durante un cierto tiempo, dando origen a agrupaciones características. Según el plano y número de divisiones pueden encontrarse en bacterias esféricas:
diplococos
estreptococos
estafilococos
sarcinas
COMO YA LO HEMOS APRENDIDO CON USTED PROFE TODOS LOS NOMBRES SE BASN SGUN EL NOMBRE.

[W10]ESPECIE: puede ser aplicada a la mayoría de los eucariotas, incluyendo hongos, algas y protozoos, pero no es aplicable a los procariotas, ya que la reproducción y el intercambio genético no son esenciales en su ciclo de vida. Dado que los microbiólogos necesitan identificar y clasificar las bacterias por diferentes razones prácticas, una especie puede definirse como una colección de cepas similares, que difieren lo suficiente de otros grupos de cepas para asegurar su reconocimiento como unidad Dado que los microbiólogos necesitan identificar y clasificar las bacterias por diferentes razones prácticas, una especie puede definirse como una colección de cepas similares, que difieren lo suficiente de otros grupos de cepas para asegurar su reconocimiento como unidad. LA VERDAD PROFE NO LE ENTENDIMOS MUY BIEN ESPEREMOS NOS ALLAMOS DESARROLLADO BIEN TRATAMOS DE RAZONARLO MUCHO
BUENO HASTA MAÑANA ATTE SUS ALUMNAS HERNANDEZ REYES RAQUEL Y RUIS HERRERA LESLIE ONEAL